Ô nhiễm nước dinh dưỡng gây ra sự phát triển quá mức của tảo và các loài thực vật cực nhỏ, trong khi các chất ô nhiễm độc hại trong nước có thể khiến thực vật bị căng thẳng hoặc thậm chí giết chết chúng. Cho dù ô nhiễm có ảnh hưởng tích cực hay tiêu cực đến đời sống thực vật, nó làm đảo lộn sự cân bằng của hệ sinh thái, thường gây ra những tác động tàn phá.
Ô nhiễm chất dinh dưỡng thường xảy ra do nhiều hoạt động của con người, bao gồm cả dòng chảy từ đất nông nghiệp. Mưa hòa tan phốt pho và nitơ từ phân bón cho cây trồng và chất thải chăn nuôi. Sự gia tăng chất dinh dưỡng dẫn đến việc tảo nở hoa tiềm ẩn gây ra các điểm chết trong nước do cạn kiệt oxy.
Mưa axit là một dạng ô nhiễm nước khác ảnh hưởng đến đời sống thực vật. Mưa axit xảy ra khi nước trong khí quyển hòa tan các chất hóa học, bao gồm sulfur dioxide và nitrogen dioxide, được hình thành bởi núi lửa và động cơ ô tô. Khi lượng mưa rơi xuống đất, nó gây ô nhiễm nguồn cung cấp nước. Nó làm giảm độ pH của nước và cuối cùng là của đất, ức chế sự phát triển của một số loài thực vật và giết chết những loài khác. Độc tính thực vật xảy ra khi các chất độc tích tụ trong môi trường và hệ thống rễ của cây trồng hấp thụ chúng. Hóa chất tích tụ trong hệ thống nước và môi trường với hiệu ứng tích lũy. Thủy ngân, cũng ảnh hưởng đến cá và động vật, có tác dụng độc hại đối với thực vật. Hạt giống không phát triển trong khi cây trưởng thành bắt đầu khô héo và chết do nhiễm độc thực vật.
