Archaea, hay vi khuẩn khảo cổ, là nhóm sinh vật nhân sơ có quan hệ gần gũi nhất với sinh vật nhân chuẩn. Điều này là do sự giống nhau của các gen và quá trình trao đổi chất mà cả sinh vật nhân thực và sinh vật nhân thực đều có. Một điểm tương đồng chính là các enzym tham gia vào quá trình phiên mã và dịch mã.
Archaea hay vi khuẩn khảo cổ là những vi sinh vật đơn bào khác biệt với vi khuẩn eubacteria và mặc dù chúng có một số đặc điểm tương tự nhưng cũng khác biệt với sinh vật nhân thực. Chúng tương tự như vi khuẩn eubacteria ở điểm chúng thiếu nhân tế bào. Chúng được biết đến với khả năng tồn tại trong các điều kiện môi trường khắc nghiệt như nhiệt độ cao và môi trường mặn. Ví dụ về những sinh vật này bao gồm các sinh vật ưa nhiệt, methanogens và các sinh vật ưa nhiệt.
