Phá rừng để lại những hậu quả tiêu cực lâu dài đã và đang xảy ra, bao gồm sự tuyệt chủng của các loài thực vật, côn trùng và động vật. Các khu rừng nhiệt đới mất đi ước tính 137 loài mỗi ngày hoặc 50.000 loài mỗi năm, theo Rainforest Nhà sản xuất. Những loài này có thể có những phẩm chất dược phẩm quan trọng, vì khoảng 25% dược phẩm phương Tây hiện nay được lấy từ các loài rừng nhiệt đới.
Một hậu quả khác của việc tàn phá rừng là mất cộng đồng và văn hóa, theo Green Peace. Những người bản địa sống trong các khu rừng ở Indonesia, Papa New Guinea và quần đảo Solomon bị đuổi khỏi nhà khi nạn phá rừng xảy ra. Ngoài ra, nguồn thức ăn của chúng bị phá hủy và nguồn nước chúng uống bị ô nhiễm dẫn đến bệnh tật. Green Peace tuyên bố rằng ít hơn 5% giá trị của những khúc gỗ lấy từ rừng được trao cho những người sống trên đất.
Phá rừng cũng có những tác động có hại đối với môi trường, bao gồm việc thải ra nhiều khí nhà kính. Green Peace ước tính rằng nạn phá rừng chiếm 20% lượng carbon dioxide thải vào khí quyển. Carbon dioxide là một loại khí nhà kính góp phần vào sự nóng lên toàn cầu. Theo Rainforest Maker, việc phá hủy một cái cây ngăn cản việc tích trữ 1,5 tấn carbon đồng thời giải phóng carbon dioxide vào khí quyển.
