Mục đích của thuốc thử tím pha lê trong quy trình nhuộm Gram là để nhuộm mẫu vi khuẩn. Khi mẫu vi khuẩn ở trên phiến kính, tím pha lê được bôi và để trong 10-60 giây, tùy thuộc vào kích thước mẫu và sau đó phần dư thừa được đổ bỏ cẩn thận.
Nhuộm Gram được sử dụng khi một mẫu vi khuẩn cần được phân biệt thành hai nhóm: gram dương và gram âm. Nó được sử dụng để phát hiện nhiễm trùng trong các mẫu dịch cơ thể và có thể được sử dụng nhanh hơn so với nuôi cấy vi khuẩn, khi thời gian chẩn đoán bệnh là không thể thiếu để điều trị bệnh nhân.