Mưa axit ảnh hưởng đến động vật bằng cách thay đổi độ pH trong môi trường của chúng. Độ axit tăng lên gây ra những thay đổi về giải phẫu, làm giảm dân số của một số sinh vật và có thể ảnh hưởng đến sinh sản ở một số loài.
National Geographic định nghĩa mưa axit là bất kỳ loại mưa nào có chứa hàm lượng axit sulfuric và nitric cao. Khi mưa axit đến Trái đất, axit ngấm vào đất và xâm nhập vào các hệ thống nước, chẳng hạn như sông, hồ và suối. Trong các hệ sinh thái dưới nước, mưa axit gây hại cho động vật bằng cách làm tăng độ chua của nước. Điều này làm tăng lượng nhôm hấp thụ từ đất xung quanh, làm cho nước trở nên độc hại đối với động vật thủy sinh. Ở những khu vực có độ pH của nước giảm xuống dưới 5, có ít tôm càng và côn trùng hơn. Độ chua tăng lên cũng ảnh hưởng đến tốc độ tăng trưởng và khả năng sinh sản của cá.
Mưa axit cũng có ảnh hưởng đến các loài động vật sống trong rừng. Mưa thúc đẩy sự thay đổi độ pH của đất, khiến cây khó hấp thụ nước hơn. Ảnh hưởng của mưa axit cũng làm cho cây cối và các loại cây khác khó chống chọi với bệnh tật, côn trùng phá hoại và thay đổi nhiệt độ. Khi cây cối bị hư hại và thực vật chết đi, động vật sống trong hệ sinh thái rừng sẽ không còn nhiều thức ăn.
