Metanol hòa tan nhiều trong nước, do đó, một lượng lớn metanol có thể được hòa tan trong nước. Độ hòa tan cao này là do chuỗi hydrocacbon ngắn và sự hiện diện của nhóm hydroxyl.
Các rượu đều bao gồm một nhóm hydroxyl gắn với một chuỗi hydrocacbon. Nhóm hydroxyl ưa nước và tạo liên kết hydro với các phân tử nước, cho phép rượu hòa tan trong nước. Chuỗi hydrocacbon kỵ nước và tạo liên kết với các chuỗi hydrocacbon khác. Liên kết hydro giữa nhóm hydroxyl và nước mạnh hơn liên kết giữa các chuỗi hydrocacbon nếu các chuỗi rất ngắn. Chuỗi hydrocacbon của metanol chỉ chứa một cacbon, cho phép các phân tử nước liên kết tự do với các nhóm hydroxyl.
