Quỹ George Mateljan giải thích rằng các loại hạt có thể khó tiêu hóa vì chúng chứa nhiều chất béo. Tuy nhiên, khi các loại hạt được ăn vừa phải, tỷ lệ tiêu hóa tiêu chuẩn sẽ được áp dụng. Theo Mayo Clinic, tốc độ tiêu hóa trung bình là 53 giờ.
Healthy.net cho biết hệ tiêu hóa của một số người có phản ứng ác cảm với các loại hạt do rối loạn tiêu hóa. Các rối loạn gây ra sự chậm trễ hoặc đau trong đường tiêu hóa khi phản ứng với các loại hạt bao gồm nồng độ axit trong dạ dày thấp, sỏi mật và bệnh túi mật. Những phản ứng không tốt này là do thành phần chất béo trong các loại hạt gây ra. Axit clohydric, các enzym tiêu hóa và mật do túi mật tạo ra là những chất cần thiết để tiêu hóa các loại hạt đúng cách.