Lewis và Clark đã băng qua Dãy núi Bitterroot, một phân đoạn phía bắc của Dãy núi Rocky. Mặc dù các đỉnh của Dãy núi Bitter Junior cao trung bình từ 9.000 đến hơn 11.000 feet, nhưng họ đã tìm thấy một tuyến đường về phía tây qua những ngọn núi xuyên qua Đèo Lolo, ở độ cao 5.236 feet.
Một trong những mục tiêu chính của chuyến thám hiểm của Lewis và Clark là tìm kiếm Đường đi Tây Bắc, một tuyến đường thủy giả định từ Đại Tây Dương đến Thái Bình Dương. Các mục tiêu khác bao gồm tiếp xúc ngoại giao với người Mỹ bản địa, mở rộng hoạt động buôn bán lông thú sang các vùng lãnh thổ mới, và khám phá sông Missouri, Tây Bắc Thái Bình Dương và mua Louisiana mới mua. Họ lên sông Missouri vào tháng 5 năm 1804 cùng với 33 người đàn ông khác. Ở Bắc Dakota, họ đã xây dựng Pháo đài Mandan để chờ qua mùa đông. Vào tháng 4 năm 1805, họ tiếp tục dọc theo Missouri cho đến khi đến Dãy núi Rocky, nơi họ phải tiếp tục cưỡi ngựa. Ở phía bên kia của Đường phân chia lục địa, họ tiếp tục đi ca nô xuôi theo các sông Clearwater và Snake cho đến khi đến sông Columbia, con đường đưa họ đến Thái Bình Dương.
Lewis và Clark và những người trong đoàn thám hiểm của họ, được gọi là Quân đoàn Khám phá, đã trở lại St. Louis vào tháng 9 năm 1806 sau khi đã đi gần 8.000 dặm. Họ đã được Tổng thống Thomas Jefferson, Quốc hội và công chúng Mỹ coi là anh hùng.