Nấm mốc sinh sản vô tính, sử dụng nguyên phân để hình thành bào tử và hữu tính. Sinh sản hữu tính liên quan đến sự tiếp xúc giữa các chủng nấm giao phối khác nhau để tạo thành bào tử.
Nấm mốc bánh mì, Rhizopus stolonifer, thường sinh sản vô tính nhất. Quá trình sinh sản bắt đầu ngay sau khi nấm mốc tìm thấy chất nền thích hợp và gửi các cấu trúc nuôi dưỡng của nó, hoặc sợi nấm, để hấp thụ chất dinh dưỡng. Nấm được nuôi dưỡng tạo thành các cấu trúc thẳng đứng chứa các bào tử nấm. Các bào tử này là sản phẩm của quá trình nguyên phân và ở lại với nấm cho đến khi có điều kiện thích hợp để phát tán; thông thường, bào tử phát hành khi thời tiết ấm và khô. Các bào tử mới hiện đáp xuống một chất nền mới và vòng đời của nấm vẫn tiếp tục.
Nấm mốc bánh mì không có giới tính khác nhau như động vật và một số loài thực vật, nhưng nó có hai chủng giao phối. Khi các chủng khác nhau phát triển gần nhau, các kích thích tố đặc biệt khiến chúng chạm vào nhau. Khi chúng chạm vào nhau, các tế bào của tế bào của chúng kết hợp với nhau, và các hạt nhân của chúng gặp nhau và kết hợp với nhau. Sự kết hợp của các hạt nhân gây ra sự hình thành một hợp tử. Cấu trúc này có thành tế bào rất dày và khả năng không hoạt động; những đặc điểm này cho phép một hợp tử sống sót trong những điều kiện khó khăn. Khi điều kiện thuận lợi, meiosis xảy ra trong bào tử để tạo bào tử cho nấm giải phóng.
