Kính hiển vi so sánh là một kính hiển vi chuyên dụng cho phép so sánh song song các vật liệu khác nhau. Được phát minh bởi Calvin Goddard vào những năm 1920, những kính hiển vi này ngày nay thường được FBI và các cơ quan khác thực thi pháp luật để xác định điểm giống nhau của các vật thể như sợi tóc và đạn dược đã bắn.
Về cơ bản, kính hiển vi so sánh là hai kính hiển vi riêng biệt được nối với nhau bằng một cây cầu bao gồm một thấu kính quan sát duy nhất. Hai đối tượng giống nhau có thể được đặt trên các sân khấu đối lập và được xem đồng thời trong cùng một trường nhìn. Điều này hỗ trợ rất nhiều cho người giám định trong việc so sánh hai vật liệu giống nhau mà không cần phải di chuyển giữa hai kính hiển vi riêng biệt.