Kế hoạch Tái thiết của Tổng thống Andrew Johnson giống với kế hoạch của Tổng thống Lincoln: Liên minh sẽ được đoàn tụ và miền Nam sẽ không bị trừng phạt. Johnson đã lên kế hoạch thực hiện điều này bằng cách tha thứ cho những người miền Nam, mặc dù họ tham chiến, cam kết trung thành với Hoa Kỳ. Ông cũng chấp nhận các tiểu bang gia nhập liên minh nếu 10 phần trăm cử tri da trắng của tiểu bang cam kết trung thành. Sau khi họ tái gia nhập liên minh, ông cho phép họ cải tổ chính phủ mà không phải làm nô lệ.
Bất chấp những bước tiến lớn trong công cuộc Tái thiết, Johnson không được đảng Cộng hòa hùng mạnh ủng hộ hoặc phổ biến. Đảng Cộng hòa muốn nhấn mạnh hơn vào việc bảo vệ những nô lệ được trả tự do và khiến việc gia nhập liên minh trở nên khó khăn hơn. Hơn nữa, những người theo Đảng Cộng hòa lo ngại về việc các bang miền Nam đang thông qua luật hạn chế quyền tự do của những cựu nô lệ nhanh như thế nào. Andrew Jackson và Quốc hội đã không làm việc tốt với nhau. Họ từ chối kế hoạch Tái thiết của anh, và ngược lại Jackson đã phủ quyết kế hoạch của họ. Tuy nhiên, Quốc hội đã có thể bỏ phiếu thông qua các kế hoạch Tái thiết của họ với một tỷ lệ đủ lớn. Quốc hội cũng hạn chế quyền lực tổng thống của Jackson thông qua việc họ thông qua Đạo luật về nhiệm kỳ. Điều này có nghĩa là Jackson không còn có thể loại bỏ những người được bổ nhiệm liên bang. Khi Jackson làm như vậy với Bộ trưởng Chiến tranh Edwin Stanton, Quốc hội đã cố gắng luận tội anh ta. Hạ viện đã bỏ phiếu để làm như vậy, nhưng cuộc bỏ phiếu ở Thượng viện đã giảm một lần. Cuộc tranh cãi này kết thúc vào năm 1869 khi Ulysses S. Grant trở thành tổng thống và hoàn toàn ủng hộ các kế hoạch Tái thiết của Quốc hội.
