Hiệu ứng nút cổ chai là một hiện tượng sinh thái trong đó quần thể của một loài bị giảm mạnh đến mức loài vẫn có thể tiếp tục được nhưng tính đa dạng di truyền của loài bị hạn chế nghiêm trọng. > Loại sự kiện này chỉ xảy ra khi các thành viên của quần thể bị giết một cách ngẫu nhiên, và cái chết của họ không liên quan gì đến sai sót di truyền hoặc không có khả năng thích nghi.
Có một số sự kiện rất cụ thể có thể gây ra hiệu ứng tắc nghẽn, bởi vì tắc nghẽn chỉ có thể được gây ra bởi các yếu tố giết chết các thành viên của quần thể một cách bừa bãi. Nếu một bệnh dịch quét qua một quần thể và giết chết những cá thể có đặc điểm di truyền nhất định hơn những người khác, thì đó không thể được coi là một tình huống tắc nghẽn vì nó chỉ đơn giản là chọn lọc tự nhiên. Tắc nghẽn cổ chai thường xảy ra sau động đất, sóng thần hoặc quá tải, bởi vì những sự kiện này giết chết một cách vô tư.
Tắc nghẽn cổ chai có hại cho quần thể vì chúng chỉ để lại một số thành viên của loài còn lại để sinh sản. Điều này có nghĩa là phần lớn vốn gen bị mất và loài phải được xây dựng lại từ cấu tạo gen của chỉ một vài cá thể. Sự thiếu đa dạng di truyền này đôi khi khiến các quần thể dễ mắc các bệnh hoặc điều kiện di truyền hơn.
Một ví dụ điển hình về sự tắc nghẽn là quần thể hải cẩu voi, loài bị săn đuổi gần như tuyệt chủng, một trang web của Đại học California giải thích. Loài này đã cố gắng xây dựng lại quần thể chỉ từ 20 thành viên, nhưng các nhà khoa học đã so sánh quần thể bị săn bắt với một quần thể khác không bị săn bắn ở cùng mức độ và nhận thấy quần thể bị săn bắt có ít đa dạng di truyền hơn.
