Hai nhóm chức luôn được tìm thấy trong axit amin là cacboxyl và nhóm amino. Cả hai nhóm đều có tính axit. Liên kết peptit xảy ra khi nhóm cacboxyl của một axit amin tham gia vào đầu amino của axit amin khác.
Một nhóm cacboxyl bao gồm một nguyên tử cacbon, hai nguyên tử oxy và một nguyên tử hydro. Nhóm amin bao gồm một nguyên tử nitơ và hai nguyên tử hydro. Các nhóm cacboxyl và amin nằm ở các đầu đối diện của một axit amin.
Hai axit amin tạo thành liên kết peptit hoặc amit khi chúng tham gia. Đầu amino và cacboxyl của hai axit amin kết hợp với nhau, và nitơ của nhóm amin liên kết với cacbon trên nhóm cacboxyl. Các hydro trong nhóm amino và một oxy trong nhóm cacboxyl kết hợp với nhau để tạo thành một phân tử nước.
