Bạn không thể nhìn thấy vi sinh vật nếu không sử dụng kính hiển vi. Bạn cũng không thể nếm hoặc ngửi các vi sinh vật như vi khuẩn trong thực phẩm bị ô nhiễm. Tuy nhiên, bạn có thể ngửi thấy mùi của vi khuẩn chuyển hóa mồ hôi. Nhiễm nấm móng chân cũng tạo ra mùi hôi.
Trong khi tất cả vi khuẩn và vi khuẩn cổ đều là vi sinh vật, chỉ có một số nấm và tảo. Một số động vật, chẳng hạn như luân trùng và hầu hết các động vật nguyên sinh, đều có kích thước siêu nhỏ. Các sinh vật nhỏ bé sống trong đất, khí quyển, dưới đáy đại dương và sâu bên trong đá. Vi sinh vật hỗ trợ phân hủy trong việc tái chế các chất dinh dưỡng trong hệ sinh thái. Các vi sinh vật trong không khí có thể ảnh hưởng đến lượng mưa và thời tiết. Những người khác hoạt động trong chu trình nitơ.
