Ấn Độ Dương, giống như nhiều đại dương trên Trái đất, là nơi sinh sống của một số loài đa dạng, bao gồm cá mao lương, cá mập trắng lớn, cá heo mũi chai, cá voi xanh, rùa biển, sứa, cá đuối gai độc, hải quỳ, biển rắn, sâu và cá đá. Các sinh vật sống ở Ấn Độ Dương có kích thước đa dạng từ vi sinh vật nhỏ bé đến một số loài động vật lớn nhất trên hành tinh, chẳng hạn như cá mập lớn và cá voi xanh. Một số sinh vật ít đe dọa đến con người và các động vật có vú khác, trong khi những sinh vật khác chứa nọc độc gây chết người hoặc phát ra độc tố mạnh, có khả năng gây hại.
Động vật ở Ấn Độ Dương bao gồm nhiều nhóm chính, bao gồm sinh vật máu nóng và máu lạnh, động vật có vỏ, cá và động vật giáp xác. Một số, như cá stonefish, Bồ Đào Nha Man-O-War, cá mao tiên và cá có vỏ hình nón xuất hiện như những sinh vật hấp dẫn và lành tính, nhưng chúng lại chứa chất độc gây chết người. Chiến tranh Man-O-Bồ Đào Nha, hình thành từ các thuộc địa của polyp, chứa các xúc tu dài và nhức nhối. Chúng có một số điểm giống với Sea Nettle, một loài sứa màu hồng nhạt có khả năng gây nguy hiểm.
Trong khi những loài động vật này sống ở vùng nước sâu hơn, những loài khác sống gần bờ biển và rạn san hô hơn. Ví dụ như cá Stonefish, cá mao tiên, cá mao tiên và cá quỷ xanh, thích vùng nước nông hơn. Cá đá hòa vào môi trường xung quanh với lớp da bên ngoài màu cát. Cá hề chứa máu có độc tố gây chết người; trong một chiến thuật sinh tồn ngược lại, chúng có màu sắc đậm và đẹp, cảnh báo những kẻ săn mồi về độc tính của chúng. Các cư dân Ấn Độ Dương khác bao gồm cá chình moray, một số loài cá đuối và cá nhồng.
