Nhược điểm của việc sử dụng hydro làm nhiên liệu là một số hoạt động sản xuất của nó dựa vào các nguồn tài nguyên không thể tái tạo và nó rất dễ cháy. Cũng cần có một lượng hydro lớn hơn được sử dụng để làm nhiên liệu một phương tiện khi so sánh với xăng hoặc dầu diesel.
Hiđro là nguyên tố hóa học nhẹ nhất trong bảng tuần hoàn, với số hiệu nguyên tử 1. Nó là một chất khí không mùi và không màu. Tế bào hydro có thể cung cấp nhiên liệu cho các loại xe có động cơ, mang lại lợi ích cho môi trường vì chúng không tạo ra khí nhà kính hoặc gây ô nhiễm không khí.
Có nhiều công nghệ khác nhau được sử dụng để sản xuất hydro, một số công nghệ bao gồm các nguồn tái tạo, chẳng hạn như năng lượng gió và năng lượng mặt trời, theo Bộ Năng lượng Hoa Kỳ. Tuy nhiên, cũng có sản xuất hydro bằng cách sử dụng các nguồn không thể tái sinh như nhiên liệu hóa thạch. Mặc dù hydro là nhiên liệu thay thế, nhưng một nhược điểm là nó vẫn phụ thuộc vào than, dầu và khí tự nhiên.
Một nhược điểm khác của việc sử dụng hydro làm nhiên liệu là nó gây rủi ro vì rất dễ cháy. Hydro không cung cấp cùng một lượng năng lượng theo thể tích so với dầu diesel và xăng. Điều này tạo ra một vấn đề về lưu trữ, vì các phương tiện chạy bằng hydro cần rất nhiều nhiên liệu để chúng có thể di chuyển cùng quãng đường với các phương tiện chạy bằng nhiên liệu diesel hoặc xăng.