DNA polymerase II là một loại DNA polymerase: một loại enzyme tổng hợp các bản sao giống hệt của DNA hiện có, cho phép các tế bào đang phân chia truyền thông tin di truyền này cho các tế bào con của chúng. DNA polymerase II chỉ được tìm thấy ở sinh vật nhân sơ hoặc sinh vật đơn bào, chẳng hạn như vi khuẩn cổ và vi khuẩn đơn giản thiếu nhân và bào quan có màng.
Sinh vật nhân sơ có năm loại DNA polymerase đã biết, được đánh số từ I đến V. DNA polymerase sao chép DNA bằng cách tổng hợp trình tự các nucleotide, thành phần phân tử của DNA. Chỉ có bốn loại nucleotide trong DNA. Thứ tự cụ thể của các nucleotide này là mã di truyền kiểm soát việc tạo ra, duy trì và hoạt động của tất cả các tế bào sống. DNA polymerase đọc thứ tự của các nucleotide này và sao chép chúng chính xác để tạo ra các chuỗi DNA mới.DNA polymerase II được Thomas Kornberg phát hiện ở vi khuẩn E. coli vào năm 1970. DNA polymerase II hỗ trợ hoạt động của DNA polymerase III, là enzyme sao chép DNA chính ở sinh vật nhân sơ. Nếu DNA bị hư hỏng ngăn cản sự tiến triển của DNA polymerase III, DNA polymerase II sẽ đóng một vai trò trong quá trình tổng hợp bắt đầu lại tại một điểm khác trong sợi DNA, cho phép DNA polymerase III tiếp tục sao chép ra ngoài vùng bị hư hỏng.
DNA polymerase II cũng kiểm tra độ chính xác của các sợi DNA mới được tổng hợp. Nếu có bất kỳ lỗi nào trong quá trình sao chép, DNA polymerase II sẽ loại bỏ và loại bỏ đoạn DNA không chính xác.