Đặc điểm chính của vi khuẩn khảo cổ và vi khuẩn eubacteria là chúng đơn bào hoặc đơn bào. Vi khuẩn cổ chỉ được tìm thấy trong nước sôi nóng hoặc các loại môi trường khắc nghiệt khác, trong khi vi khuẩn eubacteria được tìm thấy ở khắp nơi.
Vi khuẩn khảo cổ được tìm thấy ban đầu tại Vườn Quốc gia Yellowstone. Loại vi khuẩn này cũng được tìm thấy dưới Thái Bình Dương, sâu trong một điểm mà đá nóng chảy và khí nóng hình thành bên trong Trái đất. Chúng sống trong điều kiện không có oxy hoặc trong môi trường có tính axit cao.
Vi khuẩn có thể là sinh vật đơn bào, nhưng chúng rất phức tạp. Phần lớn vi khuẩn thuộc loại này. Chúng đã được xếp vào danh mục riêng vì cách trang điểm hóa học độc đáo của chúng. Một số vi khuẩn có lợi, tạo ra thức ăn như sữa chua. Tuy nhiên, có một số nguyên nhân khiến mọi người bị bệnh, chẳng hạn như Streptococci.
