Chất nhầy trong dạ dày bảo vệ các tế bào đường tiêu hóa khỏi những tổn thương mà dịch vị có thể gây ra. Dịch dạ dày có tính axit cao và nếu không có chất nhầy này, axit có thể phá hủy các tế bào và mô trong dạ dày.
Chất nhầy trong dạ dày rất giàu bicarbonate, một hợp chất có tính kiềm, giúp bôi trơn và bảo vệ dạ dày. Axit dạ dày đến từ tế bào thành, một loại tế bào dạ dày, và nó là axit clohydric, là dung dịch của nước và hydro clorua. Điều này cho phép môi trường trong dạ dày có tính axit cao. Mức độ axit cao rất quan trọng để vô hiệu hóa vi khuẩn trong thực phẩm mà mọi người ăn và để kích hoạt pepsinogen, một loại enzyme.