Các loài thực vật mọc ở rừng mưa Amazon bao gồm cây ca cao, cây bơ, cây hoa lạc tiên, cây ổi và cây dây leo khoai lang. Một số loài thực vật ở Amazon là thực vật biểu sinh, chẳng hạn như phong lan, rêu và dương xỉ, không mọc trong đất mà thay vào đó trên các cây khác.
Rừng mưa Amazon có tới 80.000 loài thực vật khác nhau. Cứ 2,5 mẫu Anh có từ 40 đến 100 loài khác nhau.
Nhiều loài thực vật trong rừng mưa được sử dụng trong y học, thực phẩm và mỹ phẩm. Ví dụ, hạt ca cao là nguồn chính của sô cô la. Cây bơ tạo ra một loại quả có thể ăn được, có hàm lượng protein cao. Thành phần quan trọng nhất trong kẹo cao su có nguồn gốc từ cây chicle. Cây nho vani phát triển các loại đậu hoặc quả để lấy chiết xuất từ cây vani.
Không phải tất cả các loài thực vật được tìm thấy ở Amazon đều có các đặc tính liên quan đến thực phẩm. Những cây gỗ gụ từng bị đốn hạ và dùng làm đồ nội thất bằng gỗ cứng trước khi loài này gần như tuyệt chủng. Cây an xoa cho ra quả màu đỏ được dùng để làm thuốc nhuộm màu đỏ. Amazon là ngôi nhà nguyên thủy của cây cao su, loại cây tạo ra mủ cao su. Các sợi trong vỏ của cây kapok nhẹ và mịn, được sử dụng làm gối và chất bảo quản.