Cá tự bảo vệ mình thông qua ngụy trang bằng màu sắc, gai độc, va chạm mạnh và hóa chất. Chất độc được tiêm vào răng hoặc qua ngạnh hoặc gai là cách phòng vệ hữu ích mà cá da trơn và cá bọ cạp sử dụng.
Một số loài, chẳng hạn như cá tuế, cảnh báo những loài khác trong nhóm của chúng khi chúng thải một chất hóa học vào nước. Một con cá bơn ở Biển Đỏ được gọi là cá đế Moses tiết ra một chất hóa học hiệu quả đến mức ngay cả cá mập cũng tránh được chúng. Thường là mục tiêu của những kẻ săn mồi, mắt của cá được ngụy trang bằng một đốm đen gần phía sau cơ thể. Những kẻ săn mồi nhắm vào vị trí đó chứ không phải đầu, nơi có đủ thời gian để trốn thoát.