Tùy thuộc vào loài, có thể mất từ vài tuần đến vài tháng để trứng thằn lằn nở. Đối với thằn lằn cưng, chẳng hạn như Anoles, trứng sẽ nở vào khoảng 4 đến 6 tuần, trong khi trứng của thằn lằn hoang dã, lớn hơn, chẳng hạn như Komodo Dragons, có thể mất từ 7 đến 8 tháng để nở.
Môi trường đôi khi cũng là yếu tố quyết định thời điểm trứng của thằn lằn sẽ nở. Ví dụ, những con thằn lằn được biết đến là loài da mỏng manh đã phát triển một cơ chế sinh tồn khiến con non của chúng nở sớm từ trứng. Thông thường, trứng của loài lột da cần được ấp từ 4 đến 8 tuần trước khi chúng có thể nở. Tuy nhiên, nếu những con thằn lằn con bên trong trứng bắt đầu cảm thấy rung động cho thấy sự tiếp cận của kẻ săn mồi, chúng sẽ nở sớm để thoát khỏi kẻ săn mồi. Mặc dù đây có thể không phải là đặc điểm điển hình của tất cả các loài thằn lằn, nhưng ví dụ này nhấn mạnh điểm không nên di chuyển trứng một cách không cần thiết khi cố gắng sinh sản thằn lằn trong điều kiện nuôi nhốt.
Trong 3 đến 4 ngày đầu tiên, trứng thằn lằn sẽ "sắp đặt", nghĩa là chất chứa trong trứng sẽ lắng xuống đáy trứng. Khi điều này xảy ra, không nên đảo hoặc di chuyển trứng một cách không cần thiết, vì điều này có thể gây hại cho phôi. Ngoài ra, nếu trứng được đẻ thành chùm, chúng có thể có xu hướng dính vào nhau. Nếu điều này xảy ra, các quả trứng không nên tách rời nhau - điều này có thể làm nứt hoặc vỡ vỏ.
