Bão ảnh hưởng đến hệ sinh thái do gió gây hại và lượng mưa quá lớn; gió có thể hạ gục toàn bộ các khu rừng trong khi gió và mưa kết hợp có thể thay đổi bố cục của một khu vực. Các loài động vật sống trên cây hoặc bị lấy mất nhà do thay đổi đất thường bị giảm quần thể.
Thực vật và động vật có thể chết trong cơn bão do gió mạnh, triều cường hoặc lũ lụt. Những động vật phụ thuộc vào những sinh vật này để kiếm thức ăn sẽ không thể tìm đủ để ăn và có thể chết đói nếu không có nguồn thức ăn khác.
Các bãi biển thường bị xói mòn khi có bão. Động vật làm tổ trên bãi biển bị cuốn trôi tổ và con non. Nước xung quanh bãi biển trước đây bị thay đổi về chất lượng có thể giết chết các loài bản địa.
