Phá rừng, chuyển đổi đất và biến đổi khí hậu gây ra ba rủi ro lớn nhất đối với rừng nhiệt đới. Rừng nhiệt đới, giống như các hệ sinh thái khác, đòi hỏi những điều kiện cụ thể để có sức khỏe tối ưu. Họ phải đối mặt với sự tàn phá và thiệt hại vĩnh viễn do nhiều hoạt động của con người, chủ yếu được thúc đẩy bởi các động lực kinh tế, chẳng hạn như khai thác gỗ và canh tác thương mại.
Trong số các mối đe dọa từ rừng nhiệt đới, nạn phá rừng đặt ra nhiều vấn đề. Phá rừng liên quan đến việc chặt cây và phát quang diện tích lớn đất rừng nhiệt đới để con người sử dụng. Một số người khai thác cây trong rừng nhiệt đới, sử dụng chúng để xây dựng và tạo ra hàng tiêu dùng từ gỗ. Khai thác gỗ xảy ra hợp pháp và bất hợp pháp; trong khi việc khai thác gỗ bền vững không gây ra các mối đe dọa lớn đối với rừng nhiệt đới, thì việc khai thác gỗ bất hợp pháp sẽ phải trả một khoản phí. Theo Quỹ Động vật Hoang dã Thế giới, các khu rừng nhiệt đới ở Borneo phải đối mặt với diện tích đất bị mất hơn 55%. Nhu cầu toàn cầu về dầu cọ ngày càng tăng, một chất có trong nhiều mặt hàng thực phẩm, thúc đẩy tốc độ phá rừng. Mất đất khiến nhiều loài bản địa mất nhà cửa và không có các nguồn tài nguyên cơ bản, cuối cùng gây nguy hiểm cho sự tồn tại của chúng. Nhu cầu về đất trang trại và chăn thả gia súc cũng góp phần vào nạn phá rừng.
Việc chuyển đổi đất, chẳng hạn như biến đất rừng thành cánh đồng trồng cây đậu nành và dầu cọ, làm tăng nguy cơ lũ lụt và hỏa hoạn ở các khu vực xung quanh. Việc nhổ và chặt bỏ cây cối làm mất đi khả năng hút nước của rừng, và sự xâm hại của con người vào rừng dẫn đến những vùng đất khô cằn hơn, dễ xảy ra hỏa hoạn. Cuối cùng, biến đổi khí hậu, bao gồm lượng carbon dioxide lớn hơn trong khí quyển và mực nước biển dâng cao, gây nguy hiểm cho sức khỏe rừng nhiệt đới.
