MDHealth tuyên bố rằng mặc dù hạnh nhân có nhiều lợi ích cho sức khỏe, nhưng việc tiêu thụ quá nhiều hạnh nhân có thể gây ra một số tác dụng phụ đối với sức khỏe, chẳng hạn như tăng cân và sử dụng quá liều một số chất dinh dưỡng. Ăn quá nhiều hạnh nhân cũng có thể gây ra các tác dụng phụ khác, bao gồm tương tác tiêu cực với một số loại thuốc và các vấn đề về đường tiêu hóa.
MDHealth giải thích rằng trong khi hạnh nhân làm giảm cholesterol, chúng cũng góp phần làm tăng cân khi ăn nhiều nếu người ăn không đốt cháy thêm calo. Hạnh nhân cũng chứa một lượng chất xơ tốt. Ăn quá nhiều đôi khi dẫn đến đầy bụng hoặc táo bón. Uống nhiều nước khi ăn hạnh nhân để ngăn ngừa điều này. Tiêu thụ quá nhiều hạnh nhân cung cấp nhiều hơn lượng vitamin E được khuyến nghị, dẫn đến các triệu chứng như đau đầu, thờ ơ, tiêu chảy và đầy hơi. Hàm lượng mangan cao trong hạnh nhân tương tác xấu với một số loại thuốc, bao gồm thuốc chống loạn thần, thuốc nhuận tràng, thuốc kháng axit, một số thuốc kháng sinh và thuốc huyết áp.
Cổng San Francisco tuyên bố rằng ăn quá nhiều hạnh nhân đồng nghĩa với việc hấp thụ quá nhiều selen, đôi khi dẫn đến chứng selen. Tình trạng này phá vỡ chức năng thích hợp của hệ tiêu hóa, làm cho tóc rụng, tổn thương dây thần kinh và làm cho móng tay cực kỳ dễ gãy. Selenosis là một tình trạng nghiêm trọng. Tuy nhiên, độc tính selen hiếm khi xảy ra khi chứa quá nhiều hạnh nhân.