Trong thời Trung cổ, có 164 vị giáo hoàng được nhà thờ Công giáo La Mã chính thức công nhận. Các niên đại của thời Trung cổ khác nhau giữa các nguồn nhưng thường bao gồm ít nhất những năm từ 500 đến 1500 sau Công nguyên
Do nhà thờ nắm giữ quyền lực chính trị trên khắp châu Âu trong suốt thời kỳ Trung cổ, nên những việc làm của một số giáo hoàng từ thời đó có thể được coi là có ý nghĩa lịch sử to lớn. Nicholas II (khoảng 990 - 1061) thiết lập đời sống độc thân của giáo sĩ. Leo III (khoảng 795 - 816) lên ngôi Hoàng đế Charlemagne. Có lẽ vị giáo hoàng được biết đến nhiều nhất trong thời Trung cổ là Urban II (khoảng 1088-1099), người đã kêu gọi tất cả các Kitô hữu châu Âu loại bỏ người Hồi giáo khỏi Đất Thánh, khởi xướng các cuộc Thập tự chinh.
