Vết chính được sử dụng trong phương pháp nhuộm Gram để phát hiện vi khuẩn Gram dương. Vết chính có màu tím pha lê. Khi một vi khuẩn là Gram âm, nó sẽ mất vết sơ cấp và lấy vết thứ cấp là safranin.
Sự khác biệt về độ dày của lớp peptidoglycan của màng tế bào vi khuẩn giúp phân biệt vi khuẩn Gram dương với vi khuẩn Gram âm. Vi khuẩn Gram dương có lớp peptidoglycan dày hơn và có thể giữ được màu cơ bản là tím pha lê.Nhuộm Gram là một quy trình ba bước bao gồm nhuộm chính, khử màu để khử nước lớp peptidoglycan và nhuộm thứ cấp để xác định loại vi khuẩn.
