Ngài Isaac Newton không có anh chị em đầy đủ. Anh ấy đã có một anh trai và hai chị em gái cùng cha khác mẹ. Tên của họ là Benjamin Smith, Mary Smith và Hannah Smith Pilkington.
Cha của Ngài Isaac Newton qua đời khi ông còn là một đứa trẻ sơ sinh. Mẹ anh sau đó đã bỏ đi và tái hôn. Cô đã ra đi gần bảy năm và để lại Isaac cho cha mẹ cô nuôi dưỡng. Sau cái chết của cha dượng, Isaac được đoàn tụ với mẹ của mình. Cô mang theo hai bé gái và một bé trai mà cô có trong cuộc hôn nhân với Barnabas Smith. Đây là một hoàn cảnh gia đình hơi bất thường và người ta tin rằng Ngài Isaac Newton đã bị ảnh hưởng sâu sắc bởi sự bỏ rơi của mẹ mình.