Tế bào thực vật và động vật có một số điểm tương đồng về cấu trúc, chẳng hạn như các bào quan được liên kết trong màng và các yếu tố tế bào tương tự. Chúng cũng chứa các màng và các thuộc tính tương tự như hạt nhân, lysosome và peroxisome.
Một điểm tương đồng chính khác giữa tế bào thực vật và động vật là cả hai đều là tế bào nhân thực. Tế bào nhân thực rất phức tạp và có nhiều phương pháp tiến hóa để gán các phần khác nhau của tế bào cho các chức năng khác nhau. Scitable nói rằng các bào quan là những ngăn tế bào thực hiện các vai trò khác nhau trong tế bào nhân thực. Cơ quan ti thể sử dụng các phân tử thức ăn để sản xuất năng lượng. Lưới nội chất vận chuyển protein và hỗ trợ sản xuất màng. Lysosome tái chế các bào quan khác cũng như các đại phân tử.
Nhân của tế bào thực vật hoặc động vật có thể so sánh với não của tế bào. Scitable nói rằng hạt nhân có lẽ là quan trọng nhất trong tất cả các bào quan của sinh vật nhân thực. Theo About.com, sự hiện diện của một nhân liên kết màng thực sự là định nghĩa của tế bào nhân thực. Nhân chứa phần lớn vật chất di truyền của tế bào thực vật hoặc động vật và tổ chức thông tin này thành các phân tử DNA. Nhân cũng tạo thành các nhiễm sắc thể. Hạt nhân cũng đóng vai trò là trung tâm điều khiển của tế bào thực vật hoặc động vật và điều chỉnh mọi hoạt động của chúng.
