Tái tổ hợp xôma đề cập đến quá trình liên quan đến việc hình thành các gen immunoglobin thông qua tái tổ hợp các yếu tố di truyền dòng mầm hoặc các phân đoạn của gen immunoglobin, trong một vị trí duy nhất. Quá trình này xảy ra trong mô bạch huyết sơ cấp, là tủy xương cho tế bào B và tuyến ức cho tế bào T. Sự tái tổ hợp xôma có trước sự tiếp xúc với kháng nguyên và xảy ra trong quá trình phát triển tế bào B trong tủy xương.
Ở động vật có vú, các đoạn gen immunoglobin được sắp xếp thành các nhóm exon biến đổi (V), đa dạng (D), liên kết (J) và không đổi (C). Trong tế bào lympho của động vật có xương sống, sự tái tổ hợp soma gần như kết hợp ngẫu nhiên các đoạn gen Biến đổi, Đa dạng và Nối. Sự lựa chọn ngẫu nhiên của các gen khác nhau dẫn đến mã hóa đa dạng của các protein, phù hợp với các kháng nguyên từ vi khuẩn, ký sinh trùng, vi rút, tế bào rối loạn chức năng và phấn hoa.
Một DH và một JH được ghép ngẫu nhiên với việc loại bỏ tất cả DNA can thiệp (nối D-J). Tiếp theo là sự nối ngẫu nhiên của phân khúc VH với phân khúc DJH được sắp xếp lại. Các trình tự xen kẽ giữa VDJH và CH được phiên mã thành mRNA sơ cấp. Trong nhân, sự liên kết của mRNA sơ cấp tạo ra thông điệp trưởng thành, được dịch mã thành chuỗi H khi vận chuyển trong tế bào chất. DNA của con người cho chuỗi H có khoảng 50 phân đoạn VH chức năng, 30 phân đoạn DH và sáu phân đoạn JH. Hai CDR và ba FR đầu tiên của vùng biến đổi chuỗi nặng được mã hóa bởi VH.
Sự hình thành ngẫu nhiên của nhiều tổ hợp VJL và VDJH đa dạng tạo ra sự đa dạng tổ hợp. Mặt khác, việc nối các đoạn gen và bổ sung nucleotide vào các vị trí nối chuỗi DNA không chính xác dẫn đến sự đa dạng về chức năng.
