Pythagoras được đào tạo ở Tyre, Samos và Miletus, là Syria và Tiểu Á ngày nay, cũng như Ai Cập. Sau đó, ông thành lập trường bí ẩn của riêng mình ở Croton, miền nam nước Ý.
Khi còn là một thanh niên trên đảo Samos, giáo dục ban đầu của Pythagoras chủ yếu bao gồm học chơi đàn lia và ngâm thơ từ các tác giả như Homer. Anh ta cũng được cho là đã được giáo dục bởi người Chaldaeans và những người Syria khôn ngoan trong chuyến du hành cùng cha tới Tyre.
Các giáo viên chính của anh khi còn trẻ được coi là các nhà triết học Pherekydes, Thales và Anaximander, hai người sau này là giáo viên và học sinh sống trên Miletus.
Vào khoảng năm 535 trước Công nguyên, Pythagoras học ở Ai Cập tại đền thờ Diospolis, hay Thebes cổ đại, ngày nay là Luxor.