Sự vận động trong vương quốc nguyên thủy rất đa dạng và cực kỳ linh hoạt. Amoebas sử dụng các quá trình tế bào chất được gọi là pseudopod, trong khi các loài tham số có các hàng lông mao di chuyển đồng loạt giống như mái chèo nhỏ. Euglena và tảo hai roi sử dụng protein giống roi gọi là roi để bơi, và một số động vật nguyên sinh, chẳng hạn như tảo cát và plasmodium (sinh vật gây bệnh sốt rét), không di chuyển, có nghĩa là chúng không di chuyển độc lập.
Các lông mao và trùng roi thể hiện rất nhiều điểm tương đồng với các cấu trúc được quan sát thấy ở vi khuẩn. Điều này cho thấy rằng các protein vận động xuất hiện rất sớm trong quá trình tiến hóa. Các sinh vật nhân chuẩn khác, bao gồm cả con người, đã giữ lại những cấu trúc hữu ích này. Trong đường hô hấp của con người, các tế bào biểu mô có lông mao quét vi khuẩn trong không khí và các mảnh vụn ra khỏi đường hô hấp trở lại cổ họng nơi phản xạ ho đẩy chúng ra khỏi cơ thể. Đối với trùng roi, tinh trùng chứa các protein tương tự ở đuôi của chúng giúp chúng có thể bơi.Pseudopodia như một phương tiện di chuyển phần lớn vẫn chỉ giới hạn ở amip; Tuy nhiên, một số loại tế bào của con người vẫn giữ được đặc điểm này. Các tế bào bạch cầu thực bào, được gọi là đại thực bào, sử dụng cấu trúc tương tự như vỏ giả để nhấn chìm vi khuẩn và bào tử nấm. Các tế bào Megakaryocytes (tế bào khổng lồ trong tủy xương) mở rộng nhiều quá trình giống như pseudopod, sau đó phân cắt các mảnh tế bào chất để tạo thành tiểu cầu.