Động vật nguyên sinh là những sinh vật đơn bào nguyên thủy, một số gây bệnh cho người. Theo Trung tâm Kiểm soát và Phòng ngừa Dịch bệnh, bốn loại động vật nguyên sinh cơ bản gây ảnh hưởng cho con người, được xếp vào nhóm Sarcodina , Mastigophora, Ciliophora và Sporozoa.
Một nguyên sinh vật đáng chú ý ảnh hưởng đến con người được gọi là Trypanosoma. Protist này gây ra bệnh ngủ và bệnh Chagas. Sinh vật này được phát hiện vào đầu những năm 1900 bởi nhà nghiên cứu người Brazil Carlos Chagas. Nó được mang và truyền qua nước bọt của ruồi và bọ sát thủ khi chúng cắn người.
Theo CDC, hầu hết các nguyên sinh vật gây bệnh cho con người sống trong đường ruột và lây lan qua đường phân-miệng. Giardia là một loại vi khuẩn trùng roi gây ra các triệu chứng rất nghiêm trọng về đường ruột cho con người và nó thường mắc phải khi uống phải nước có cặn bẩn.
Các sinh vật nguyên sinh khác được truyền bởi côn trùng và các sinh vật khác. Một loại protist gây hại đặc biệt được gọi là plasmodium, gây ra căn bệnh được gọi là sốt rét. Sốt rét sống trong máu của con người và nó lây từ người này sang người khác khi muỗi đốt người bị bệnh và sau đó cắn người khác.
Việc phân loại sinh vật nguyên sinh vẫn chưa được giải quyết. Nói chung, các nhà khoa học gọi tảo nguyên sinh giống thực vật trong khi họ gọi động vật là nguyên sinh động vật. Một số sinh vật nguyên sinh khác khác với cả hai loại này và chúng giống với nấm.