pKa của một axit amin phụ thuộc vào loại, nhóm và chuỗi bên của nó. Ví dụ, khi lysine là một phần của nhóm axit cacboxylic, nó có pKa là 2,18, so với pKa là 8,95 khi nó là một phần của nhóm amin và 10,53 với chuỗi bên.
Khi ở trong nhóm axit cacboxylic, hầu hết các axit amin có giá trị pKa chỉ hơn 2, chỉ có histidin giảm xuống dưới với pKa là 1,77. Một axit có giá trị pKa dưới 2 được coi là một axit mạnh, trong khi những axit trên được coi là axit yếu. Các axit amin trong nhóm amin có giá trị pKa nằm trong khoảng từ 8s cao đến 10s thấp.