Ở tế bào nhân thực, thời gian của chu kỳ tế bào được điều chỉnh bởi kinase phụ thuộc cyclin, hoặc CDK. Các kinase phụ thuộc cyclin kích hoạt sự chuyển đổi giữa các giai đoạn của chu kỳ tế bào bằng cách phosphoryl hóa các chất nền trong tế bào.
Phosphoryl hóa là quá trình CDK biến đổi protein trong tế bào nhân thực. Việc sửa đổi các protein sẽ thay đổi cách các protein này tương tác với nhau. CDK hoạt động như tín hiệu cho một số con đường protein được bật hoặc tắt. Các CDK khác nhau hoạt động ở các giai đoạn khác nhau của chu kỳ tế bào.
Ngoài CDK, các kinase protein khác như kinase giống polo và kinase cực quang giúp kiểm soát thời gian và vị trí quá trình phosphoryl hóa diễn ra trong tế bào.