Theo Cơ quan Bảo vệ Môi trường Hoa Kỳ, nước thải có thể chứa các hóa chất gây rối loạn nội tiết (EDC), khi thải ra ngoài môi trường, có thể ảnh hưởng tiêu cực đến quần thể cá. Hai trong số những mối nguy hiểm chính bao gồm quá trình nữ hóa và phá vỡ quần thể cá.
Các nhà máy xử lý nước thải được thiết kế để loại bỏ mầm bệnh, các hạt chất thải và chất dinh dưỡng trong nước thải, nhưng EDC tiềm ẩn khó loại bỏ hơn. Những hóa chất này kết thúc trong nước thải theo nhiều cách khác nhau, vì chúng có trong các sản phẩm dược phẩm, chất tẩy rửa, xà phòng, chất dẻo, thực phẩm và các sản phẩm chăm sóc cá nhân như nước hoa. Theo EPA, sự hiện diện của EDC đã được chứng minh là làm nữ tính hóa các quần thể cá ở hạ lưu của các nhà máy xử lý nước thải.
Ảnh hưởng nghiêm trọng khác từ EDC trong nước thải là khả năng phá vỡ quần thể cá của chúng. Một nghiên cứu do Bộ Thủy sản và Đại dương Canada thực hiện đã cho cá tuế đầu mập trong hồ tiếp xúc với nồng độ estrogen thấp. Trong vòng 3 năm, sự phát triển sinh sản của cả cá tuế đực và cá cái đã bị những khiếm khuyết nghiêm trọng và dẫn đến sự tuyệt chủng của loài cá này. Lượng estrogen được sử dụng trong nghiên cứu tương tự với lượng được đo trong các đường nước bị nhiễm chất thải, điều này cho thấy EDC có trong nước thải có khả năng phá vỡ các quần thể cá hoang dã.