Một số nhược điểm của du hành vũ trụ bao gồm việc NASA chi tiền cho các dự án khi không biết mình có thể dựa vào bao nhiêu khoản đầu tư thương mại, có những rủi ro đối với sự an toàn của con người với mỗi sứ mệnh và quỹ đạo nhất định rất chậm. Ngoài ra, những thay đổi về kinh phí du hành vũ trụ có thể khiến sinh viên khó trở thành phi hành gia.
Mặc dù NASA hiện hợp tác với các công ty tư nhân để tài trợ du hành vũ trụ, nhưng không có gì đảm bảo rằng các công ty tư nhân có thể đầu tư. Trong khi nhiều người tỏ ra quan tâm, điều này có thể có nghĩa là NASA bắt đầu làm việc trên các dự án mà sau đó bị bỏ lại mà không có kinh phí thương mại. Nếu chỉ có một số ít doanh nghiệp tư nhân đầu tư thì việc thiết lập các hợp đồng sẽ trở nên kém hiệu quả. Ngoài ra, du hành vũ trụ không an toàn, với những thảm kịch lịch sử bao gồm mất tàu Challenger năm 1986 và Columbia vào năm 2003. Những tổn thất khác có thể gây tổn hại đến tính mạng con người và danh tiếng của du hành vũ trụ, dẫn đến các quy định hạn chế.
Về mặt logic, một số khía cạnh của du hành vũ trụ là một thách thức. Vì các con tàu chỉ có thể chở một lượng nhiên liệu hạn chế, chúng dựa vào quỹ đạo hành tinh và lực đẩy trọng trường để hoàn thành nhiệm vụ. Việc chuyển giao này cũng giới hạn số lần phóng tàu có thể thực hiện. Ví dụ: quá trình chuyển đổi Trái đất-sao Hỏa chỉ có sẵn 2 năm một lần và chuyển dịch Trái đất-sao Mộc có sẵn sau mỗi 13 tháng. Cả hai đều chậm.
Với việc chính phủ Liên bang chuyển tài trợ cho chương trình không gian sang các nguồn tư nhân, sinh viên sẽ có ít cơ hội trở thành phi hành gia hơn. Thông thường, họ tham gia chương trình này sau khi làm việc trong lực lượng không quân, nhưng ít tài trợ của liên bang hơn đồng nghĩa với việc giảm khả năng xảy ra điều này.
