Các bào quan chứa các enzym tiêu hóa được gọi là lysosome. Các cấu trúc tế bào này chủ yếu có chức năng phân hủy các chất phân tử phức tạp, chẳng hạn như carbohydrate, lipid, protein và axit nucleic.
Các tế bào của sinh vật nhân thực được phân chia thành các đơn vị chức năng gọi là bào quan, thực hiện các nhiệm vụ chuyên biệt cao trong tế bào. Phần lớn các bào quan có màng bao bọc hoặc được bao bọc bởi màng sinh chất. Mặc dù có hình dạng và tổ chức tương tự như màng sinh chất của tế bào, nhưng thành phần của màng bào quan có cấu tạo khác với protein và phospholipid. Một số bào quan, chẳng hạn như bộ máy Golgi và nhân, tồn tại như những đơn vị riêng lẻ, trong khi những bào quan khác, bao gồm lục lạp, ti thể và lysosome, có với số lượng lớn.Lysosome là những cấu trúc cực nhỏ, giống như túi, lơ lửng trong tế bào của màng sinh chất của tế bào. Các enzym tiêu hóa chứa trong các bào quan này được gọi là acid hydrolase. Ngoài việc phân hủy các mảnh thức ăn, các enzym cũng tiêu hóa các màng bị hư hỏng, hỗ trợ tái chế các phần còn sót lại của tế bào. Một chức năng quan trọng khác của lysosome là ngăn chặn vi sinh vật xâm nhập vào tế bào. Các vi khuẩn và vi rút có hại thường được nhắm mục tiêu và tiêu hóa bởi các lysosome được tìm thấy trong các tế bào bạch cầu. Do đặc tính tiêu hóa của chúng, các hydrolase axit được phân lập khỏi phần còn lại của tế bào bởi màng bao bọc các lysosome. Nếu không, các enzym sẽ tiêu hóa tất cả các thành phần của tế bào.