Nấm có lợi cho con người như là nguồn thực phẩm và hỗ trợ thiết yếu cho các loại thực phẩm khác. Chúng tạo ra các loại thuốc quan trọng và thậm chí còn được sử dụng làm thuốc trừ sâu sinh học. Chúng cũng là những sinh vật phân hủy quan trọng, hay sinh vật thực dưỡng, giúp phân hủy chất thải hữu cơ thành các dạng hữu ích hơn.
Từ 80% đến 90% cây cối và cỏ không thể tồn tại nếu không có mối quan hệ cộng sinh với nấm trong đất. Điều này làm cho nấm trở nên cần thiết để trồng phần lớn các loại cây lương thực, ngay cả khi chúng không được tiêu thụ trực tiếp.
Nấm cũng có thể bảo vệ cây lương thực bằng cách hoạt động như mầm bệnh cho côn trùng dịch hại. Các loài nấm làm được điều này đã tiến hóa để chỉ tấn công một số loài côn trùng nhất định và khiến cây trồng không bị tổn thương. Chúng phát triển qua cơ thể côn trùng và cuối cùng xuất hiện để phát tán bào tử của chúng cho các loài bọ khác.
Nấm cũng rất quan trọng trong chế biến thực phẩm và là thành phần thiết yếu trong một số loại pho mát và trong quá trình làm bánh mì và lên men rượu. Màu xanh lam trong pho mát xanh là một loại nấm.
Nấm cũng là một nguồn chính của thuốc kháng sinh, chất ức chế miễn dịch, tiền chất steroid và các chất cầm máu. Nấm rất hữu ích cho việc nghiên cứu vì chúng dễ phát triển, giống như vi khuẩn, nhưng có cấu trúc tế bào và di truyền gần hơn nhiều so với con người.
