Khi mưa axit rơi vào rừng, nó sẽ rửa trôi và hòa tan các chất dinh dưỡng giúp cây cối và thực vật phát triển, chẳng hạn như magiê và canxi. Nó giải phóng nhôm làm giảm khả năng hấp thụ nước của cây. Trong khi cây không có khả năng hấp thụ nhôm có trong tự nhiên, mưa axit có thể chuyển nó thành nhôm nitrat hoặc nhôm sunfat có thể gây hại cho cây. Nó làm suy yếu khả năng phòng thủ tự nhiên của cây và khiến chúng dễ bị tổn thương hơn do thời tiết lạnh, côn trùng, bệnh tật và các tác nhân gây căng thẳng sinh thái khác. Mưa có tính axit cũng làm mòn lớp phủ bảo vệ của lá, khiến chúng dễ bị hư hại và ngăn cản chúng quang hợp tốt.
Ngoài tác động đến môi trường, mưa axit cũng có thể khiến các tòa nhà và tượng bị xói mòn nhanh hơn, đặc biệt là những công trình làm từ đá vôi hoặc đá sa thạch, vì những loại đá này dễ bị ảnh hưởng bởi ô nhiễm không khí cũng như mưa axit.