Lý thuyết của John Dalton về lý thuyết nguyên tử, xuất bản năm 1808, đã tuyên bố không chính xác rằng nguyên tử là thành phần không thể phân chia của vật chất. Điều này sau đó được chứng minh là không chính xác khi sự tồn tại của các electron, proton và neutron được chứng minh . Tuy nhiên, Dalton đã đúng khi nói rằng nguyên tử là hạt nhỏ nhất tham gia vào một phản ứng hóa học.
Lý thuyết của Dalton cũng tuyên bố rằng các nguyên tử kết hợp với nhau để tạo thành các hợp chất theo một tỷ lệ các số nguyên đơn giản. Điều này được chứng minh là không chính xác về tỷ lệ nguyên tử trong các hợp chất hữu cơ phức tạp, chẳng hạn như đường sucrose, hoặc đường ăn, với công thức phân tử là C 12 H 22 O 11 . Tuy nhiên, lý thuyết nguyên tử của Dalton đã nhận ra một cách chính xác sự khác biệt cơ bản giữa nguyên tử và phân tử. Công việc của ông cũng giúp giải thích các quy luật liên quan khi các chất hóa học kết hợp với nhau.