Các cấu trúc tự nhiên bao gồm các hẻm núi như Grand Canyon ở Hoa Kỳ, các ngọn núi như Đỉnh Everest và thậm chí cả nhà và tổ mà động vật tự làm, bao gồm tổ ong, đồi kiến, tổ chim và đập hải ly. Bất kỳ hình thức nào tự đứng vững và có hình thức xác định mà không phải do con người tạo ra đều được coi là cấu trúc tự nhiên. Điều này trái ngược với các cấu trúc nhân tạo như tòa nhà và cầu.
Tổ ong là ví dụ tuyệt vời về sự phức tạp tiềm ẩn và thiết kế thông minh của các cấu trúc tự nhiên. Sử dụng các vật liệu có sẵn trong tự nhiên và tuân theo một mô hình hành vi thích nghi mà các loài ong khác biết, những loài côn trùng này xây dựng tổ ong phức tạp với các khoang hình lục giác để chứa mật ong, sáp và ong non.