Eubacteria là một vương quốc khổng lồ, đa dạng của các vi sinh vật nhân sơ bao gồm chlamydia, E. coli và cyanobacteria. Các sinh vật vi khuẩn được sử dụng để sản xuất pho mát và rượu vang. Chúng có thể gây nhiễm trùng nghiêm trọng ở người và đôi khi, như trong trường hợp của hệ thực vật đường ruột của con người, chúng thay đổi nhanh chóng từ hữu ích sang có hại.
Vi khuẩn sinh dục đều là sinh vật nhân sơ. Điều này có nghĩa là các thành viên của vương quốc này, rộng lớn và đa dạng như vương quốc động thực vật, thiếu nhân tế bào và tạo ra năng lượng mà không có các mối quan hệ cộng sinh xác định sinh vật nhân chuẩn.
Vi khuẩn lam, một loại vi khuẩn eubacteria, là một trong những dạng sống sớm nhất xuất hiện trong hồ sơ hóa thạch. Các tế bào mô đệm thuộc địa đã xây dựng những gò đất lớn, được gọi là đá thạch nhũ, trên Trái đất cách đây 3 tỷ rưỡi năm. Những loài tảo xanh lam này, như chúng thường được gọi, là những nhà sản xuất ôxy chính đầu tiên trên Trái đất, và chúng vẫn là trung tâm để duy trì trạng thái cân bằng của bầu khí quyển Trái đất. Một số vi khuẩn lam cố định nitơ trực tiếp từ không khí, làm giàu đất và cho phép thực vật phát triển.
Vi khuẩn có hại tồn tại dưới dạng ký sinh trùng. Chlamydia và xoắn khuẩn gây bệnh giang mai là hai ví dụ về vi khuẩn có khả năng phá hủy. E. coli được cho là một loại trực khuẩn có hại khác. Loài này thường cư trú trong ruột, nơi nó hỗ trợ tiêu hóa, nhưng nó có thể trở nên nguy hiểm trong một số trường hợp nhất định. E. coli kháng vancomyicin là một bệnh nhiễm trùng phổ biến được tìm thấy trong các khu bệnh viện.