Một chuỗi dài gồm nhiều axit amin được gọi là polypeptit. Một polypeptit có hàng trăm hoặc thậm chí hàng nghìn axit amin liên kết với nhau, trong khi một peptit là một chuỗi axit amin nhỏ hơn. Như tên cho thấy, polypeptit bao gồm nhiều peptit.
Một chuỗi dài các axit amin cũng có thể được coi là protein. Nói chung, chuỗi axit cơ bản được coi là một polypeptit cho đến khi nó ở dạng ba chiều cuối cùng, có chức năng. Ngoài ra, một số protein nhất định được cấu tạo từ cả polypeptit và các nhóm phân tử khác được gọi là đồng yếu tố hoặc nhóm giả. Protein chịu trách nhiệm cho một loạt các nhiệm vụ sinh học ở hầu hết các sinh vật sống.