Nếu được bảo quản đúng cách, mật ong sẽ giữ được vô thời hạn. Mật ong có thời hạn sử dụng rất lâu nếu được đậy kín ở nơi khô ráo và thoáng mát. Tuy nhiên, theo thời gian, mật ong có thể mất màu vàng hoặc độ đặc, nhưng mật ong vẫn an toàn để tiêu thụ.
Để khắc phục các vấn đề về độ đặc như mật ong kết tinh, hãy đặt hộp đựng mật ong vào nước ấm cho đến khi các tinh thể hòa tan hoàn toàn. Bảo quản mật ong có thể làm cho màu của nó sẫm lại và nó cũng có thể làm mất một số hương vị của nó. Tuy nhiên, giữ mật ong trong hộp kín có thể giúp bảo quản mật ong tốt hơn.
Mật ong có thời hạn sử dụng dài đến nỗi các nhà khảo cổ học đã phát hiện ra những hũ mật ong nguyên sơ hàng nghìn năm tuổi trong các ngôi mộ Ai Cập. Một lý do khiến mật ong để được lâu là do thành phần hóa học của nó. Mật ong chứa đường, hydrogen peroxide và thiếu nước. Tính axit của nó là một yếu tố khác để nó không bị hư hỏng, vì vi khuẩn khó phát triển hơn trong môi trường axit.