Heli có khối lượng nguyên tử bằng 4,00 đơn vị khối lượng nguyên tử. Nguyên tố ở thể khí cũng có số hiệu nguyên tử là 2 và ký hiệu nguyên tử là He. Số nguyên tử của nó tương quan với số proton và electron mà nguyên tố có, trong khi số neutron của nguyên tố có thể được xác định từ khối lượng của nó.
Heli có đúng hai proton và hai electron; nó có số hiệu nguyên tử là 2. Nó cũng có hai nơtron, vì khối lượng nguyên tử trừ đi số nguyên tử của nó bằng hai. Nguyên tố này được xếp vào nhóm khí quý và được tìm thấy ở nhóm 18 trong bảng tuần hoàn. Nó là một nguyên tử trơ vì nó có tám điện tử hóa trị và hoàn toàn ổn định.