Tính đến năm 2014, có ba bộ khóa trong Kênh đào Panama: Ổ khóa Gatun ba ngăn, Ổ khóa Pedro Miguel một ngăn và Ổ khóa Miraflores hai ngăn. Mỗi ổ khóa là được xây dựng đôi để chứa hai làn đường chuyển tuyến độc lập.
Các âu thuyền trên Kênh đào Panama nâng tàu 85 feet lên độ cao chính của kênh rồi lại hạ xuống. Các con tàu đi lên theo ba khoang và sau đó đi xuống theo ba khoang, mất khoảng 8 đến 10 giờ cho một chuyến hành trình hoàn chỉnh qua kênh.
Dự án mở rộng Kênh đào Panama, dự kiến hoàn thành vào năm 2015, bổ sung thêm hai khóa ba vào kênh. Các khóa mới này lớn hơn 65% và được thiết kế để tiết kiệm nhiều nước ngọt hơn cho mỗi lần vận chuyển so với các khóa cũ.