Như tên gọi của nó, hydro lần đầu tiên được quan sát thấy trong nước. Nước bao gồm một nguyên tử oxy được liên kết với hai nguyên tử hydro. Lượng nước dồi dào trên Trái đất khiến nó trở thành nguồn cung cấp hydro phổ biến nhất trên hành tinh. Tuy nhiên, hydro tinh khiết rất hiếm trên Trái đất do xu hướng phản ứng khi có oxy và kết tủa dưới dạng hơi nước.
Hydro nguyên tử và phân tử phổ biến nhất ngoài Trái đất. Hydro là thành phần chính của Mặt trời, cũng như hầu hết các ngôi sao khác, và nó có thể được quan sát thấy với số lượng lớn trong toàn vũ trụ. Thông thường, hydro tạo thành thành phần chính của một số tinh vân nhất định, cái gọi là "vườn ươm sao", nơi ươm mầm thế hệ sao tiếp theo.
Hydro cũng là thành phần chính của bầu khí quyển của các hành tinh khí khổng lồ. Sao Mộc, Sao Thổ, Sao Thiên Vương và Sao Hải Vương đều có sự gia tăng của hydro và các hợp chất khác nhau của hydro trong hóa học của chúng. Hóa chất giàu hydro này là một điểm khác biệt quan trọng khi mô tả một hành tinh. Bởi vì hydro và oxy không thể được giữ ở trạng thái cân bằng trong cùng một bầu khí quyển, một hành tinh có thể được mô tả bằng cách nào khí chiếm ưu thế hơn không khí của nó. Một thế giới giàu oxy, chẳng hạn như Trái đất, được cho là có bầu khí quyển oxy hóa, trong khi thế giới giàu hydro, chẳng hạn như Sao Mộc, có bầu khí quyển có tính khử.
