Dạng hình học phân tử của IF5, còn được gọi là iot pentaflorua, là một hình chóp có đáy là hình vuông bao quanh một nguyên tử iot ở trung tâm. Mỗi góc của hình chóp là một nguyên tử flo.
Góc giữa mỗi liên kết trong phân tử là 90 độ đối với bốn nguyên tử flo tạo nên đáy của hình chóp và 180 độ đối với một nguyên tử flo tạo nên điểm của hình chóp. Cấu trúc hai chiều của iot pentaflorua được viết ra dưới dạng một nguyên tử iot trung tâm được bao quanh bởi năm nguyên tử florua trong một hình sao giống như dấu hoa thị, nhưng điều này là để thuận tiện và không tương ứng với hình dạng thực của phân tử hoặc các góc liên kết liên quan .
Pentaflorua brom có hình dạng rất giống với pentaflorua iot.
