FAD bị khử thành FADH2 trong ti thể trong chu trình Krebs, còn được gọi là chu trình axit xitric hoặc chu trình TCA. FADH2 là một dạng khử của FAD (flavin adenine dinucleotide).
Chu trình Krebs là một phần quan trọng của quá trình hô hấp tế bào hiếu khí. Hô hấp tế bào bao gồm quá trình oxy hóa thực phẩm thành carbon dioxide và nước trong một quá trình gồm nhiều giai đoạn. Thế năng được giải phóng ở mỗi bước của quá trình hô hấp được lưu trữ dưới dạng liên kết hóa học trong FADH2, NADH2 và cuối cùng là ATP (adenosine triphosphate). Chu trình Krebs bao gồm một chuỗi tám phản ứng dẫn đến sự hình thành FADH2 và NADH, cả hai đều đóng vai trò là nhiên liệu cho bước cuối cùng của quá trình hô hấp, vận chuyển điện tử. Sau khi quá trình hô hấp hoàn tất, oxy cần thiết để oxy hóa NADH và FADH2 trở lại NAD và FAD để chúng có thể được tái sử dụng trong các chu trình Krebs trong tương lai. Năng lượng giải phóng từ quá trình oxy hóa NADH và FADH2 được sử dụng để hình thành ATP, nguồn năng lượng cho tế bào.